要保证电子档案长期保存系统的安全性，可以从以下几个方面进行考虑：
物理安全：电子档案长期保存系统应具备可靠的物理安全措施，如访问控制、监控和报警系统等，以防止未经授权的人员接触和破坏系统硬件设备。同时，系统应具备容错和冗余能力，以确保在硬件设备出现故障时能够快速恢复。
网络安全：电子档案长期保存系统应具备强大的网络安全防护措施，如防火墙、入侵检测和病毒防护等，以防止网络攻击和病毒入侵。同时，系统应采用加密技术对电子档案数据进行加密传输和存储，以确保数据的安全性。
数据安全：电子档案长期保存系统应具备完善的数据安全措施，如数据备份、恢复和迁移等，以防止数据丢失、损坏或被非法访问。系统应采用可靠的加密技术对电子档案数据进行加密存储，以确保数据的安全性。同时，系统应支持对电子档案数据的完整性校验和备份恢复机制，以确保数据的完整性和可用性。
用户管理：电子档案长期保存系统应建立严格的用户管理制度，包括用户身份认证、权限控制和操作审计等。系统应对不同用户设定不同的访问权限，并记录用户的操作日志，以便对用户行为进行监控和分析。
法规遵从：电子档案长期保存系统应遵守相关的法律法规和标准要求，如《中华人民共和国电子签名法》、《中华人民共和国网络安全法》等。系统应建立完善的信息保密制度和安全审计机制，以确保系统的合规性和安全性。
综上所述，要保证电子档案长期保存系统的安全性，需要从物理安全、网络安全、数据安全、用户管理和法规遵从等方面进行全方面考虑和设计。同时，系统应具备可扩展性和灵活性，以满足不断增长的应用需求和技术发展。
